Будучи игроком, Зонин выступал на позициях защитника и полузащитника, играл в высшем дивизионе за ленинградские “Динамо” и “Трудовые резервы”.
Герман Семёнович был выдающимся тренером. Первый трофей — Кубок стран Балтийского моря — он завоевал именно с “Трудовыми резервами” в 1959 году. В 1960-м вывел воронежский “Труд” в высший дивизион.
С 1965 по 1967 год Зонин тренировал сборную Бирмы. А в 1972 году сделал чемпионом СССР никому не известную луганскую “Зарю”. В том же году Зонин провёл три матча в должности главного тренера сборной СССР.
В 1973 году Герман Зонин стал главным тренером “Зенита”. Под его руководством команда сыграла 162 официальных матча и добилась лучших за 70-е годы результатов: 5-е место в чемпионате страны и выход в полуфинал Кубка СССР.
